No le veo ningun problema, si trasfieres el dinero a banorte antes de la fecha limite de pago (cuando te hacen el retiro), no le veo el problema.
Ahora bien al dejar de ser una cuenta de nomina el banco puede cambiarla a una cuenta normal en donde te pueden generar comisiones, como la de no tener un saldo minimo que te puede perjudicar.
Lo mejor es que te den el numero de credito para depositarlos directamente y asi podras cancelar la cuenta de nomina. Ve al servicios a cliente y diles que de digan como depositar en esa cuenta del prestamo y si no lo quieren diles que pagaras por adelantado una cantidad.
Saludos